国务院国资委于2008年3月决定对中联公司股权进行调整，2008年5月以《关于中联煤层气有限责任公司股权调整框架协议有关意见的回复》（国资委规划﹝2008﹞405号）批准中联公司股权调整方案，2009年4月7日以《关于中联煤层气有限责任公司国有股权协议转让有关问题的批复》（国资产权﹝2009﹞235号）同意将中石油股份公司所持中联公司50%国有股权协议转让给中煤集团，同时，中联公司部分区块和资产有偿转让给中石油。
目前，交割工作已经结束，保留在中联公司的区块共27个，总面积为20,151 km2，其中，对外合作区块14个，总面积15915km2 。
股权调整后，中联公司成立了新一届领导班子，其中，孙茂远任执行董事（法定代表人）、秦继荣任党委书记、冯三利任总经理、彭文任总会计师、郭本广任副总经理、吴建光任副总经理兼总工程师、叶建平任总经理助理。公司设置了10个职能部门，分别是综合办公室、党群工作部、人事劳资部、财务资产部、企业发展部、经营管理部、科技管理部、国际合作与勘探部、生产管理部、安全监察局。目前，公司拥有员工246人，其中：公司总部109人、晋城分公司137人；股权调整中，调入中石油员工38人，大部分业务骨干仍保留在中联公司。
